Le tableau ci-dessous schématise les interfaces d'une installation de méthanisation. On peut voir ainsi les « gisements amont » (substrats) et les « gisements aval » (débouchés énergétiques et résidus).

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       Plusieurs sources principales de gisements amont existent : les stations de traitement des eaux usées (boues d’épuration), les Centres de tri sélectif avec les déchets fermentescibles (déchets ménagers, industriels), les déchets agricoles et déchets d’élevage qui peuvent être traités par des unités de méthanisation au niveau des exploitations agricoles, les déchets agro-alimentaires...

       La différence entre biogaz de décharge et biogaz d'unité de méthanisation réside essentiellement dans la part de méthane produit.